危害我国燕麦的栽培较严重的病害有：燕麦坚黑穗病、散黑穗病、燕麦冠锈病、秆锈病和燕麦红叶病等。，虫害地上主要有蚜虫、黏虫、草地螟、土蝗、夜蛾；地下害虫主要油金针虫、蛴螬、蝼蛄、地老虎等。
（一）常见病害的防治：
1．燕麦黑穗病的防治
主要有三条措施，即选用无菌或抗病良种；合理轮作倒茬；药剂拌种。如，用50%可菌丹按种子量的0.3%
-0.5%，播种前5-7天拌种；用25%萎锈灵按种子量的0.3%拌种；50%福美双按种子量的0.3%拌种等。
燕麦红叶病的防治：在常年蚜虫出现之前，在田间、地头、向阳、窝风处及时检查，只要发现中心病株，及时喷药火蚜控制传毒。用40%乐果乳油2000-3000倍液喷雾；用80%敌敌畏乳油3000倍液喷雾；50%辛硫磷乳油2000倍液喷雾；20%速灭杀丁乳油3000-5000倍液喷雾；50%避蚜雾可湿性粉剂10克兑水50-60千克每亩喷雾；消灭田间地埂周围杂草，控制寄主和病毒来源等。
2．燕麦秆锈病的防治
选用抗锈高产良种；消灭病株残体，清除田间杂草寄主；避免连作，实行豌豆一小麦一马铃薯一裸燕麦一亚麻一豌豆轮作方式；加强栽培管理，多中耕，增强植株抗病能力，合理施肥，防止贪青晚熟，施用磷钾肥促进早熟；发病及时喷药控制，用25%三唑酮可湿性粉剂每亩3.5克，发病初期兑水50升喷雾；20%萎锈灵乳油2000倍液喷雾等。
（二）常见虫害的防治
l．防治蚜虫
燕麦进入孕穗期、出穗期，容易发生蚜虫，可用800倍乐果乳剂或1000倍24.5%绿维虫螨药剂进行喷雾防治；
2．防治黏虫
黏虫是麦类季发性害虫，耍抓住黏虫三龄期以前，每亩喷施黏虫粉2.5-3千克或1000倍24.5%绿维虫螨药液进行防治；
3．防治草地螟
秋季进行耕耙，破坏草地螟的越冬环境，增加越冬草地螟的死亡率；春季在越冬代成虫产卵后而未孵化前铲除田间及地周围的杂草，集中处理，可杀死一部分虫卵，并减少早期孵化幼虫的食物，减轻为害；90%敌百虫或80%敌敌畏1000倍液、40%乐果1500倍液喷雾，对三龄前幼虫有较好的防治效果。
4．地下害虫的防治
诱杀成虫，对地老虎在成虫盛发期间放置诱杀液（废蜜糖加酸菜汤，稍加白酒，再加敌百虫100倍液少许），蛴螬、蝼蛄可灯光诱杀或马粪诱集捕杀；人工捕杀幼虫，地老虎可在每天早晨在受害植株附近扒土捕杀，蛴螬可犁地拾虫，沿蝼蛄隧道捕杀蝼蛄的若虫、卵；药剂拌种，每500千克种子用20%甲基异柳磷乳油1.5-2.5千克，或用50%锌硫磷乳油0.5千克加25-50千克拌种，效果可达90%以上。
