牡丹的繁殖，可用播种法、分株法、嫁接法、扦插法、压条繁殖法及组织培养法。其中，常用分株和嫁接法繁殖。牡丹分株的母株，一般都是利用健壮的株丛，进行分株繁殖的母株上应尽量保留根蘖，新苗上的根应该全部保留，方便生长5年可以多生新苗。牡丹的嫁接繁殖，根据使用的砧木分为两种，一种是野生牡丹，一种是用芍药根。
一、分株繁殖
1、牡丹的分株繁殖在明代被广泛采用。具体方法是挖掘整株生长茂盛的大株牡丹，从根系纹理的交接处分开。每株所分子株的数量取决于原株的大小，大者多分，小者可以少分。一般来说，每3-4株是一株，并且根系相对完整。用硫磺粉稍微和泥。涂抹或擦拭根部的伤口，可另行栽培。
2、分株繁殖的时间最好在每年秋分到霜降期间及时进行为好。此时，气温和地温比较高，牡丹处于半休眠状态，但营养生长时间还有相当长一段时间，进行分株栽培对根部生长影响不大，分株栽培后可生出新根和少量的株芽。如果分株栽培过晚，当年的根部生长很弱，或者不发生新根，次年春天，植株发育弱，根弱不耐旱，容易死亡。如果分株过早，气温、地温比较高，也能迅速成长，容易引起秋发。
3、牡丹分株的母株，一般都是利用健壮的株丛。进行分株繁殖的母株上应尽量保留根蘖，新苗上的根应该全部保留，方便生长5年可以多生新苗。这种的株苗种植后比较容易生存，生长旺盛。根保留得越多，生长就越旺盛。
二、嫁接繁殖
1、牡丹的嫁接繁殖，根据使用的砧木分为两种，一种是野生牡丹，一种是用芍药根。
2、常用的牡丹嫁接法主要有嵌接法、腹接法和芽接法三种：
（1）嵌接法用芍药根做砧木，因为芍药根柔软无硬心，易嫁接，根粗而且短，养分充足，接活后初期生长旺盛。如果用牡丹根嫁接，木质部比较硬，嫁接的时候困难，但寿命比较长。嫁接的时间一般是每年9月下旬至10月上旬为最佳时间。其砧木是直径2-3厘米、长10-15厘米的粗壮无病虫害的芍药根。
（2）腹接法是种高接换头改良品种的方法，利用劣质牡丹或8-10年生的药用牡丹植株上的众多枝条，嫁接成不同颜色光泽的优良品种。嫁接时间为7月上旬至8月中旬。首先，选择品种优良、植物肥壮、无病虫的牡丹植株，剪取地面发出的土芽枝，或者当年生的短枝长度为5-7厘米，最好有2-3个壮芽短枝作为接穗。在接穗上留下一个叶柄。选择接穗后，在接穗下部芽的背面斜削一刀，成为马耳形，在马耳形的另一面斜削成楔形，使得嫁接后两面可以连接到木质部和韧皮部之间的形成层组织，容易生存。牡丹腹接前后，除在雨季不灌溉外，应保持植株正常生长的适当湿度。
（3）芽接法是牡丹繁殖和培育多品种，多花色于一株的有效方法。芽接时间在5-7月之间进行，嫁接时最好是晴天。其方法有贴皮法和换芽法两种。贴皮法是在砧木当年生的枝条上与木质部相连切掉一块长方形或盾形的切口，再将接穗的腋芽与木质部相连切割大小相同的芽块。然后，很快将芽块贴在砧木的切口上，并用塑料绳拧紧。换芽法是将砧木上嫁接部位的腋芽与形成层一起去除，保留木质部位的完整芽胚，然后用同样的方法将穗的腋芽同样剥离，迅速覆盖到砧木的芽胚上，注意两者吻合，最后用塑料绳子扎紧。嫁接的植株应及时浇水、松土、施肥，促进愈合。
三、扦插繁殖
1、扦插繁殖是利用牡丹枝容易生根繁殖新株的一种方法，是无性繁殖方法之一。方法是先把扦插的枝条剪掉，脱离母株，然后入土壤或其他基质内使其生根，成为新株。
2、牡丹扦插繁殖的枝条，要选择牡丹根部发出的当年生土芽枝，或者在牡丹整形修剪时，要选择茎干饱满、顶芽饱满、无病虫害的枝条做穗，长10-18厘米。牡丹的根是肉质的根，喜高燥，忌潮湿，耐干旱。因此，育苗床应选择通风向阳的地方，筑成高床育苗。扦插时，扦插一畦浇灌一畦，一次浇透。
四、播种繁殖
播种繁殖是利用种子繁殖后代或选择养育新品种，是一种有性的繁殖方法。播种前要对土壤进行比较细致的整理消毒，土地要深耕细作，施足底肥。然后筑成70-80厘米宽的小畦，可以在穴播、条播。播种不要太深。以3-4厘米为度，播种后的覆土和要面平。再轻轻地使土壤踩实，立即浇透水。
五、压条繁殖
牡丹压条法是利用枝条可以产生不定根的道理进行的繁殖方法，将枝条压倒或者在植株上用土压埋，不脱离母株，保持土壤湿润，枝条被埋处生根，然后切断栽培，成为新株，同样属于牡丹的无性繁殖法。这种方法主要有套盆培土压条法和双平法。
六、组织培养
植物的组织培养繁殖，是根据植物组织细胞的全能性，利用牡丹的胚、花芽、茎尖、嫩叶和叶柄进行离体培养。一般将这些将这些材料放入75%的酒精中浸泡5-10分钟，立即投入无菌水中洗涤。然后在5%的安替福民溶液中浸泡7-10分钟进行表面灭菌，用无菌水清洗3-4次，最后放入培养基础进行无菌培养。基本培养基为MS，其他附加成分主要包括不同浓度或不同组合的吲哚乙酸、萘乙酸、吲哚丁酸、赤霉素、水解蛋白等。
