管辖权异议申请诉讼费收取的情况有两种
(一)被告提出管辖权异议是否预交案件受理费，现行法律没有规定
在国务院《诉讼费用交纳办法》出台之前，被告提出管辖权异议的，审判实践中一般做法是，通知被告预交案件受理费，如其不预交则视为撤回管辖权异议申请《诉讼费用交纳办法》施行后，在管辖权异议办理中对案件受理费的收取非常混乱有的法院要求被告预交;有的法院不要求被告预交，而是要求被告在驳回裁定生效后再行交纳;有的法院干脆不收案件受理费造成这一现状的原因是《诉讼费用交纳办法》规定的含混模糊
《诉讼费用交纳办法》第十三条第(六)项规定，“当事人提出案件管辖权异议，异议不成立的，每件交纳50元至100元”根据此规定，管辖权异议的案件受理费是以结果论英雄，被告所提异议成立时，不象其他案件受理费那样由败诉方即原告承担，而是不收取案件受理费只有被告所提异议不成立的，才收取案件受理费同时，《诉讼费用交纳办法》第二十条还规定，“案件受理费由原告、有独立请求权的第三人、上诉人预交被告提起反诉，依照本办法规定需要交纳案件受理费的，由被告预交追索劳动报酬的案件可以不预交案件受理费”其中对于提出管辖权异议的被告是否预交案件受理费没有做出规定
(二)被告提出管辖权异议应预交案件受理费
第一，无论案件受理费还是申请费均以预交为原则，不预交为例外从《诉讼费用交纳办法》的规定看，只有三类案件不用预交案件受理费和申请费，即追索劳动报酬的案件、申请执行、申请破产清算
第二，驳回管辖权异议裁定生效后交纳不具有操作性管辖权异议不成立被驳回后，异议处理程序已经完结，被告没有交纳案件受理费的动力其拒不交纳案件受理费，法院也只能走执行程序，此种做法过于浪费诉讼资源综上，被告提出管辖权异议的，应通知其限期交纳案件受理费，逾期不交纳的视为未提出申请;如最终经审查被告所提异议成立，裁定移送的，则同时退回预收的案件受理费
对管辖权存在异议的情况，可以提出管辖权异议，管辖权异议的案件受理费用一般是由被告预交，案件完结之后由败诉的一方缴纳费用，当事人提出案件管辖权异议，异议不成立的，每件交纳五十元至一百元
